彻底改变 Top-down 蛋白质序列分析

OmniScape™ 2025

用户友好的 Top-Down 蛋白质序列分析和注释工具,数据分析快速可靠,简化分析流程

从头测序分析

结果轻松验证

Top-down 序列分析软件

通过 OmniScape™ 了解您的目标蛋白

准确性
先进的 OmniWave™ 算法简化从复杂的多级谱图中提取高置信度的谱峰列表
通用性
OmniScape™ 可以处理几乎来自任何质谱的数据,便于不同方法结果间相互补充
灵活性
支持从头测序和基于谱图库检索,实现未知序列和已知序列的分析
可靠性
一流的交互式验证工具,谱图谱峰识别并进行全面注释,轻松展示数据

专为操作简单灵活而设计

来自 ESI 和 MALDI 多种类型的 MSn 数据可用于生成谱峰列表和序列注释


 

Top-Down 蛋白质序列分析的有力工具:1、蛋白质从头测序: 2、同源蛋白检索:3、N 端、C 端序列确认:4、蛋白质变体评价

 

 

OmniWave™ 算法进行谱图注释确保高质量的结果用于从头测序或者序列验证分析流程

分析 Top-Down 质谱数据具有一定的挑战,因此, Bottom-Up 方法相较于直接在蛋白水平进行分析更加普遍。然而,在完整蛋白水平表征蛋白质可以提供理解生物学独一无二的视角。

OmniScape™ 致力于解决 Top-Down 典型的难题来减少数据处理过程中的挑战,帮助 Top-Down 分析方法成为蛋白质分析方法的主流:

  • Top-down 复杂的谱图往往谱峰容易重叠、存在不同价态带电离子,OmniScape™ 先进的 OmniWave™ 算法可以解决这个问题,帮助用户获得高质量的谱峰列表;
  • 研究人员面临未知肽段鉴定、重组蛋白序列确认等一系列分析问题,OmniScape™ 支持基于同源蛋白检索的从头测序分析和已知序列的序列匹配鉴定,满足这些应用场景的需求;
  • 单个谱峰的手动验证繁琐且非常耗时,OmniScape™ 可快速验证匹配质量,提升高质量精度仪器用户分析速度。

单一的分析方法通常不足以分析复杂的完整蛋白质,包括复杂的蛋白质形态。OmniScape™ 灵活的设计,允许用户导入多数 ESIMALDI 的数据,或者合并多种碎裂模式的实验结果。



为满足您的 Top-Down 需求而设计

组合谱图的序列覆盖率更高,可提高鉴定的可信度

用户可以根据所需蛋白质表征水平选择两种不同的分析操作流程—蛋白质从头测序鉴定或者 PTMs 和其他蛋白变体序列确认。

从头测序分析
OmniScape ™提供简化分析流程 ( OmniWave™ ) 计算序列标签进行基于同源性的检索,快速的谱峰验证和生成的序列标签可以节省数小时的人工操作时间。

序列验证
当已知序列可用时,无论是谱峰匹配还是同源蛋白检索,OmniScape™ 都可以根据包括动态修饰的序列信息轻松评估数据,比较鉴定结果确定最有可能的候选蛋白,从而可以直接比较和追踪结果。

结果组合 
最后,当单次谱图不足以解释序列信息时,可以很容易地合并多个结果,提高序列覆盖程度,获得高置信度的综合注释鉴定。

兼容 MALDI Top-Down 序列分析流程

neofleX™ 采集的牛碳酸酐酶的 MALDI-ISD 谱图

MALDI Top-Down 测序是一种快速高效 ( 采集时间少于 1 秒 ) 的分析方式,可用于鉴定包括一级序列和末端修饰的纯化蛋白。该方法在一瞬间完成测量,得到一系列单电荷碎片离子。先前的研究表明这种方法可为高达 30 kDa 分子提供全面的序列覆盖。

OmniWave™ 算法可在 MALDI-TDS 谱图中自动寻找谱峰并自动提取谱峰单同位素质量,即使是低信噪比碎片峰也是如此。

该软件通过计算从头测序可能的序列标签来解释所测试到的谱峰,然后序列标签会用于同源蛋白检索来得到推测的结果。

通过序列确认分析流程,可以根据数据结果测试得到与鉴定蛋白相关的一级序列和修饰信息,提高序列覆盖率和评估样品中的蛋白质变体。

“ OmniScape™ 解决方案满足了我们在生物技术行业生产重组蛋白的真正需求。”

Christian Isak Jørgensen, Ph.D., Senior Science Manager, Novonesis, Lyngby, Denmark

“ OmniScape™ 直观的控制功能,可以更快更容易获得 Top-down 谱图碎片的注释和验证。我喜欢将鼠标悬停在谱图上,很容易就可以匹配验证碎片。

 

我兴奋于从头测序 de novo 功能,它将帮助我们在非靶向 Top-down 蛋白质组学研究中发现和注释蛋白质。

 

OmniScape™ 最令人印象深刻的功能是其基于不同的动态修饰类型自动匹配给出蛋白质变体结果。”

Boris Krichel, Ph.D., Postdoctoral Fellow, University of Wisconsin-Madison, WI, USA