核磁探头是磁场、无线电频率和样品相互作用的核心元件。针对不同应用的优化探头配置将保证磁体挥发最佳性能。大多数探头的标准配置是脉冲场梯度和-150至+180摄氏度的温度范围。
像Smartprobe或iProbe这样的主力探头最适合化学部门或化学和制药业的化学合成实验室配备的常规实验室。布鲁克的三共振或四共振探头是生物分子或代谢组学应用的理想选择。小体积探头提供了更高的灵敏度，流动探头允许直接耦合到分离系统。 专门的探头包括用于少量样品的微量探头，用于核磁共振与HPLC耦合的流动探头，为石油化工和聚合物分析而优化的高温探头。电池研究和离子液体的研究可以从高功率扩散探头中受益。
固体MAS探头的转子直径从7到0.7毫米不等，后者的旋转速度可达111 kHz。低温探头（低温冷却的探头）的灵敏度显著提升，支持科学家观察到前些年还被认为过少的样品量。
