SpatialOMx® 空间定位组学驱动
ESI/MALDI 无折中操作
实现高空间分辨的成像实验并不是一件容易的工作。布鲁克推出了全新 microGRID 技术 -- 整合了 MALDI 机械平台和 smartbeam 3D 激光器的光束定位系统,进一步提升了质谱成像实验的图像质量,可获得 5 μm 的超高空间分辨率。
microGRID 是一款适用于所有 timsTOF fleX 系列质谱仪的选配功能模块,将它整合进布鲁克现有的质谱成像工作流程中,展现出了突破极限的超高空间分辨率。该技术与布鲁克的自动一体化的成像数据采集流程 SCiLS™ autopilot 无缝衔接,使它不仅适用于成像专家,也同样适用于新购入成像仪器的用户及常规的成像数据采集应用。
该技术与布鲁克的 SCiLS™ Lab 软件配合使用,可实现对于高分辨成像数据的深度挖掘。
“我们所做的研究工作经常要与病理学家打交道,由于病理学家们习惯于通过高分辨的显微镜来做观察和判断,因此对质谱成像的图像结果有很高的要求 —— 不允许图像中出现由于技术所限的缺陷,此外,成像数据需要覆盖尽量大的观察范围。布鲁克的 microGRID 技术的引入,使我们毫不费力地对大尺寸的组织切片做 MALDI 成像数据采集,用以对病理切片建立多组学和多模态的综合图像。”
双离子源设计将无标记分子定位与 PASEF® LC-MS/MS 鉴定匹配,解析生物样本的分子变化。
建立在 shotgun 蛋白组学标准上的 timsTOF fleX 将布鲁克一流的 4D-组学分析与尖端的 MALDI 成像技术整合于一个平台,包括高频率的 smartbeam 3D 激光器。配置有双离子源的 timsTOF fleX,把持久稳定的 ESI 分析和组织分子空间分布集成于一体,是进行空间定位组学研究的理想平台。在此之前,没有质谱仪能为组学研究者同时提供这两种能力。
ESI 和 MALDI 的切换操作,只需在软件中开启 smartbeam 3D 激光源,仅需几秒即可完成。简单的切换操作意味着从组学深度鉴定和定量流程到组织高清成像的方便转换,又不影响效率和功能,从而发现真正有用的信息。
由 MALDI 和 ESI 产生的离子,经过同一路径从离子源到达探测器,因此 MALDI 工作流程可以利用 timsTOF HT 的主要优势,包括根据分子碰撞截面 ( CCS ) 来进行捕集离子淌度分离( trapped ion mobility separation,TIMS )。调谐和校准可在 ESI 模式下进行,并用于 MALDI 模式,方便了仪器的优化。
TIMS 允许根据离子形状分离分子。离子与气流一起进入双 TIMS 装置,在第一个TIMS 分析器通过电场进行累积。实际分离发生在第二个 TIMS 分离器。通过降低电位以时间和空间的方式释放离子。可变扫描速度和淌度范围适应性可对不同种类分子优化,为用户带来更多灵活性。
将特征区域 MALDI 成像和深度多组学分析结合现在变得容易可行。MALDI 成像适用于类型广泛的分析物,包括代谢物、脂类或聚糖,并与显微工作流程无缝衔接。针对空间定位组学,MALDI 成像可识别特征区域化合物分布。timsTOF fleX 采用双离子源设计,与可靠的高品质消耗品和用户友好软件一起使用,方便了研究工作,节省了研究人员的时间。使用布鲁克 IntelliSlides™ 预制玻片,使 MALDI 成像和空间定位组学流程在 timsTOF fleX 上完全自动化。
捕集离子淌度谱( TIMS )有助于复杂样品( 如组织切片 )的分析。通过分离近质量或同分异构的代谢物、脂质、肽段或糖苷,以获得分析物的真实空间定位。高质量分辨率无助于这些问题的解决,timsTOF fleX 提供了唯一的机会来区分同分异构体的分布。
碰撞横截面( CCS )是 TIMS 给出的测量结果,提供了从另一角度来验证质谱分析结果。CCS 关联软件智能地将空间 MALDI-TIMS 成像数据与多组学结果相匹配,并使鉴定结果与重要的形态学内容相关联。
timsTOF fleX 是一台多功能的质谱仪,用于测量样品的分子情况。timsTOF fleX 建立在布鲁克开创性 timsTOF HT 平台上,功能齐全、速度快、灵敏度高的 ESI 质谱,可用于所有多组学分析。结合了高空间分辨率的 MALDI 源和平台机械专业设计,用于解析分子分布和带来组学分析的空间维度。将蛋白质组学分析转换为空间蛋白质组学,将脂质组学转换为空间脂质组学,将代谢组学转换为空间代谢组学,并获取数据的组织学背景。与其它学科相结合,从你的分析数据中获取更多信息以达到科研目标。
为质谱成像初学者量身打造的自动一体化成像数据采集流程 SCiLS™ autopilot
我们提供 “ 购入即用 ” 的成像耗材和软件产品,帮您迅速采集数据,并随后挖掘出组织的分子表型信息。我们推出了基于 IntelliSlides® 预制载玻片的自动一体化成像数据采集流程,不仅大大减少了对用户输入的操作要求,还能确保所采集数据的高品质和可重现性。我司还推出了预制的 fleXmatrix® 基质,高品质的基质可以保证实验效果并简化基质施加过程。
作为质谱成像数据处理的 “ 行业金标准 ”,SCiLS™ Lab 软件可以实现原始数据的可视化以及后续的数据统计分析操作。此外,SCiLS™ Lab 可以与 MetaboScape® 软件联用,实现了通过数据库检索信息或 LC/MS 实验结果直接对高分辨的 MALDI 成像热图进行快速分子注释的功能。将这种联用机制应用于空间定位组学工作流程中,可实现生物背景信息与整体组学或单细胞组学信息的有效整合。
timsTOF fleX 实现 SpatialOMx®
无论蛋白质组学、脂质组学、糖组学还是代谢组学,timsTOF fleX 都是空间定位组学分析的理想平台。使用专利的smartbeam 3D 技术进行快速、无标记的 MALDI 成像,以绘制样品的分子分布图,并鉴定感兴趣的区域,对它们进一步深入分析。由 PASEF® 技术支持的 LC-MS/MS 分析可以进行最高水平的鉴定并得到最可靠的结果。
肿瘤远比看到的还复杂
癌症的微环境是由健康细胞、肿瘤细胞、结缔组织、血管和炎症在不同时间点以不同的比例组合而成。每一种成分都有其独特的化合物分子标记。研究人员对疾病状态的判断在很大程度上依赖于组织病理学的解释,并在生物分子的背景下创建这些图谱,从而在传统的组学和理解疾病之间架起了桥梁。
癌细胞和其它疾病状态具有显著的遗传和表观遗传修饰,影响基因组表达层次。无论你观察的是蛋白质组、脂质组还是代谢组,化合物的空间分布都包含了有价值的解释信息。要了解复杂的样品,除了质量和电荷外,还需要有 timsTOF fleX 的离子淌度功能提供无与伦比的分析深度。近质量干扰可被区分,同分异构体可被分离。这有助于组织中近质量脂质的准确定位。原位 MS/MS 以及 PASEF® 技术支持的 4D- 多组学研究方案使您能够识别更多感兴趣的分析物。
布鲁克的业界领先的应用软件,现在可以直接对组织中的目标分子注释。只需将数据导入到 SCiLS™ Lab 软件,定义感兴趣的区域,并将峰列表数据导出到 MetaboScape®。使用 LC-MS/MS 建立的数据库或成分列表对各个峰进行注释,然后导出注释表并送回到 SCiLS™ Lab 进行可视化。从 SCiLS™ Lab 软件中,可以使用通路和熟悉的命名法而不是分子量可视化实验结果,从而缩短从数据到最终结果的时间。
“ timsTOF fleX 质谱系统是一种创新工具,可协同多种分析功能,从而开发出新的组学工作流程。对于质谱成像,特别是在组织代谢组学和糖组学应用,它可能带来潜在的变革。”
“ 在我们的成像实验流程中,要求每个研究人员自己来制备组织切片、然后交到我们测试中心进行 MALDI 基质的喷涂和成像数据采集;与其让每个人都自己在ITO载玻片上做定位标记,我们决定购买 IntelliSlides® 预制载玻片并推广给大学的每个研究人员。IntelliSlides® 的使用极大地简化了整个实验准备过程,此外,它所包含的序列码可以确保每个成像实验都具有完整的、可追溯的实验记录。”
*仅供研究使用,不能用于临床诊断程序。