高通量质谱法,驱动靶向蛋白质降解研究

探索现代质谱法如何推动精准有效的靶向蛋白质降解研究,变革药物发现。

全面的高通量蛋白质组学:靶向蛋白质降解的游戏规则变革者

靶向蛋白质降解剂是一类具有应用前景的药物,其具有可以治疗如癌症等疾病 “ 不可成药 ” 靶点的潜力,因此近年来备受关注。尽管这类药物的开发面临着一系列挑战,但是现代质谱分析技术可为其提供有效助力。

质谱分析技术在药物发现过程中发挥着至关重要的作用。研究人员可以用其鉴定和定量与疾病信号通路相关的蛋白质,并检测蛋白质组水平的变化。这一步骤对于理解和表征潜在的具有特异性的降解剂或候选分子胶至关重要,其能够提供潜在脱靶效应的直接生物物理信息。为了实现对大量样本队列的准确定量,建立一个融合高通量、深度蛋白组鉴定且高专属性的工作流程非常必要。

大幅提升复杂生物系统分析的灵敏度和效率

布鲁克 4D-蛋白质组学生态系统为研究人员提供了全面的解决方案,在样本制备、数据生成和分析等方面,最大程度地提高灵敏度和分析效率,从而实现高质量工作流程。这个强大的生态系统从样本制备、分离到数据采集和分析无缝衔接,为研究人员分析复杂的生物系统信息提供了一种高效且精简的方法。在实验室配备先进的工具,例如捕集离子淌度质谱(TIMS)、PepSep™ C18 HPLC 柱和 Bruker ProteoScape™ 分析软件,就可实现完整解决方案,获得高质量且重现性高的数据。

BeatBox 组织匀浆仪及细胞裂解仪,大幅提升效率

BeatBox 可以进行高效、标准化、可重复的组织和细胞匀浆,革新了样品前处理流程。即使只有少量样本,BeatBox 也能够获得高产量蛋白质,是靶向蛋白降解和精准医疗工作流程的理想选择。BeatBox 具有样品承载量宽及扩展性强的特性,可以确保多种下游分析结果的一致性和可靠性。

PreOmics iST 试剂盒,增强质谱工作流程,获得高重现性结果

样品制备在基于质谱的蛋白质组学工作流程中至关重要,因为它是方法流程可重复的关键因素。然而起始材料的多样性对样本制备带来了一定挑战,如不同的细胞和组织类型。为解决这一问题,PreOmics 基于其创新的 in-StageTip( iST )技术,提供了一体化样品制备解决方案。该解决方案易操作、通用性强,而且能够兼容各种样本类型。iST 技术将复杂的工作流程简化为只需三步操作流程的试剂盒,节省时间,提高处理效率。无论是手动、半自动还是全自动,标准化且可重复的iST试剂盒都能在 2 小时内高效地完成蛋白质组学样品制备,便于质谱分析。

iST 技术无论采用何种样品,都具有出色的性能。

(A)Ramos B 细胞,用 iST 制备样品,然后通过 LC-MS 分析鉴定出可重复的大量蛋白质组。(B)使用 BeatBox 或对照装置将不同类型的小鼠组织匀浆,然后使用 iST 技术制备样品,通过 LC-MS 进行分析。无论什么组织类型,使用 BeatBox 匀浆都可以鉴定出大量蛋白质,并提高蛋白质鉴定量。

PepSep™ 高效分离,匹配 timsTOF 采集速度

高性能的分离方法能够带来高灵敏和可重复的测试结果。PepSep™ MAX 柱强化了质谱仪器的性能,为研究人员研究下一代蛋白降解剂提供了重要工具。PepSep™ C18 柱与 timsTOF 尖端科技相结合,助力科学家在靶向蛋白降解分析中获得更好的灵敏度。提高您研究效率的同时,帮助您深入了解细胞生命过程的复杂世界。请准备踏上一段变革之旅,用 PepSep 柱让科学的可能性无限增大。

联合 TIMS 和 PASEF®,发挥超高灵敏度

随着靶向蛋白降解剂的兴起,对样品进行高分辨质谱分析,包括对不同嵌合物的气相分离,对于了解药物对蛋白质稳态的影响至关重要。TIMS 技术对蛋白降解剂分析时,可通过聚焦前体离子来提高灵敏度,并通过基于碰撞截面( CCS )分离气相离子来提高选择性。

利用平行累积连续碎裂技术( PASEF® ),TIMS技术能够快速和高灵敏度地分析复杂的蛋白质混合物。 PASEF® 能够同时分析多个前体离子,提高目标蛋白质检测的灵敏度和特异性。

TIMS 技术的高灵敏度能够检测低丰度肽,因此能够更好地识别和定量包括翻译后修饰( PTMs )等在内的复杂的肽混合物。这对于靶向蛋白质降解分析至关重要,因为这些药物通常在特定的低表达蛋白质靶标上起作用。

解锁高分辨率多肽分离,快速准确的检测低丰度蛋白,提高蛋白靶点定量。 体验可靠和准确的数据,可以帮助开发治疗癌症等疾病的新药。

NEOsphere Biotechnologies 公司 —— 蛋白质组学筛选,解锁潜在蛋白降解剂

靶向蛋白质降解精准分析的终极软件

使用 Bruker ProteoScape™ 软件,及其自带的 TIMScore 功能,可将您的靶向蛋白降解剂分析提升到一个新的水平。 该软件利用机器学习和碰撞截面( CCS )值,提高了靶向蛋白降解剂检测的灵敏度和特异性。

通过数据依赖性(dda-PASEF )和数据非依赖性( dia-PASEF® )采集模式,研究人员可以实时获得蛋白质降解途径的全面视图。 dda-PASEF 模式可以用于建立丰富的谱库,而 dia-PASEF 模式可以以绝佳的速度,用于对蛋白质组进行深度定量。 有了 Bruker ProteoScape™ 软件,研究人员可以兼而有之,从而获得进行蛋白质降解物分析新发现所需的精确度和准确度。

应用 Bruker ProteoScape™ 软件,轻松追踪数据质量,发现问题结果,并能深度挖掘样品细节信息,灵活探索定量结果。

结合 DIA 和 Spectronaut® 18, 提升靶向蛋白质降解( TPD )分析通量

Spectronaut® 18 攻克了TPD研究中的挑战,在进行高通量分析的同时而不影响灵敏度。 通过数据非依赖性采集模式( DIA )和 Spectronaut® 18,您可以在最大限度地提高通量的同时保持卓越的灵敏度。

凭借其深度学习增强肽识别,Spectronaut® 能够更大范围地发现前体离子和蛋白质,提升全面分析的灵敏度。 利用 Linux 操作系统和云兼容性来优化计算资源,确保高效的数据处理和分析。

Spectronaut® 18 还配备了改进的 directDIA+工作流程,在采集完第一个样本后立即开始分析数据集,将从样品进样到可以开始数据分析的时间缩短了 80% 以上,从而极大地提高效率。因此通过 Spectronaut®,可以加速您的 TPD 分析,获得药物机制的关键见解,并提升您的研究能力。

使用 Biognosys CRO 服务,加速您的 TPD 研究

即使有内部的仪器和专家,外包给基于质谱技术的 CRO 服务公司也能提供额外的价值。Biognosys 将帮助您确保溢流能力,加速大规模研究,并应用创新的工作流程。Biognosy 的 TrueDiscovery™ 平台提供独特的深度、无偏见的蛋白质组分析,从而表征降解轮廓谱和蛋白质周转率。

Biognosys 拥有先进的设施,以及领先的良好实验室规范( GLP )认证和良好临床规范( GCP )兼容的质谱实验室,能够帮助您进行如大规模蛋白质组学研究等工作。