Metabolomics Solution
Metabolomics Solution

代谢组学解决方案

代谢组学的每一步都至关重要...

简单易用的 T-ReX® LC-QTOF 代谢组学解决方案

在动态代谢过程相关的化合物的鉴定过程中,有几个关键步骤非常重要,包括样品制备、数据采集和数据评估。只有控制好这些工作流程的所有步骤,才能在生物学背景下获得有意义的见解。为了简化这一工作流程,布鲁克公司与加拿大阿尔伯塔大学的厉良教授及其团队合作开发了 T-ReX® LC-QTOF 解决方案。

T-ReX® LC-QTOF 解决方案 —— 为研究人员提供非靶向代谢组学研究的领先方案

非靶向代谢组学的第一个关键步骤是样品制备的可重复性。因此,该代谢组学解决方案提供了制备典型临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序 (SOP)。

使用 T-ReX® LC-QTOF 解决方案,无需对 LC-MS/MS 参数进行优化,样品制备后即可在非靶向代谢组学工作流程中获取高质量的 LC-MS/MS 数据。针对样品大队列分析需要高保留时间稳定性的情况,可将 Elute UHPLC 与专用的 T-ReX® Elute Metabolomics-kit 相配合,值得注意的是,配套的反向液相色谱柱 Kit,可以使样本的保留时间与布鲁克 HMDB 代谢物库 2.0 中的值相匹配。impact II 使用优化的参数用于 MS/MS 数据采集,依托其强大的性能保证了高质量数据的输出,适用于复杂样品的深入研究。

数据采集完成后,MetaboScape® 软件可提供流程化的数据评估步骤,自动、准确地对化合物进行鉴定:

  • 独特的 T-ReX® 3D 特征提取方法是后续代谢物鉴定和统计分析的关键。通过自动进行保留时间对齐和区域完整提取,可提取所有相关信息,从而实现可靠的代谢物鉴定,同时降低统计分析中的假阴性率
  • 作为该代谢组学解决方案的一部分,布鲁克 HMDB 代谢物库 2.0 提供了 > 800 种代谢物的 MS/MS 图谱,以及 > 600 种相关代谢物的保留时间信息,该数据库是提高特征物鉴定可靠性的先决条件
  • 注释质量(AQ)评分可快速预览每个注释结果的可信度
  • Pathway Mapping 功能可将鉴定出的化合物整合于生物学通路中

我们很高兴能和布鲁克合作开发综合型的 T-ReX® LC-QTOF 应用方案。”该解决方案的建立为有关的已知内源性代谢物可靠鉴定提供了基础,并能利用代谢通路图将这些代谢物整合于生物学通路中进行生物学解释。该解决方案将为研究人员在尿液或血浆等典型研究样本的非靶向代谢组学方面提供一个良好的开端。

Dr. Liang Li, Professor of Chemistry, University of Alberta, Canada

利用磁共振质谱法( MRMS )进行表型分析

在表型代谢组学研究过程当中,通过 UHPLC-QTOF-MS/MS 分析,可对复杂混合物进行深度的解析。通常情况下,需要将不同的液相色谱法和正负离子模式的数据结合在一起,其劣势在于分析每个样品所需的时间较长。

磁共振质谱( MRMS )因其出色的分辨率可省去耗时的色谱分离,加快了表型组学和代谢组学研究的通量。基于直接进样分析( FIA )或 MALDI 的工作流程可用于检测 LC-MS 分析中不易检测到的化合物,并同时分析已知和未知代谢物。

对于表型组学研究中通常遇到的高通量需求,MRMS aXelerate 是对现有 UHPLC-QTOF-MS/MS 分析的补充。无液相色谱法的工作流程可在每个样品中检测到超过 1,000 种的中高级代谢物并生成分子式,还能发现许多LC-MS检测不到的代谢物,包括极性化合物。通过 FIA 或 MALDI 与 MRMS结合的方式,可以实现对复杂样品(如尿液和血浆提取物)的表型研究进行高通量的分析。MetaboScape 中的 T-ReX 2D 强大的数据提取功能为自动注释提供了信心。MRMS质量精确度小于 0.2 ppm,质量分辨率超过 100 万,从而提高了同位素精细结构的保真度。

在最近发表的这篇论文中,我们了解到 FIA-CASI-MRMS 工作流程如何探索代谢 “ 暗物质 ” —— 提升人类代谢组数据库的匹配度( 2.6 倍 )以及对 IFS ( Isotopic Fine Structure )方法的提升。

Philippe Schmitt Kopplin: Extreme Resolution FTMS can revolutionize research in metabolomics

“ 我们建立了新的发现方法来描述生物学和地球化学中复杂系统的组成。 MRMS eXtreme Resolution 使我们得以解决下一代的代谢表征工作:在动态的生物学和化学过程当中,快速对数以百计的已知代谢产物和数以千计的新代谢产物进行表征。 MRMS 和 MetaboScape 的结合也使其他研究者将目光投向这一新兴的、令人兴奋的领域 —— 代谢“暗物质”的探索 ”

Prof. Philippe Schmitt-Kopplin, Analytical BioGeoChemistry, Helmholtz Zentrum München, Germany

 

仅供研究使用。不适用于临床诊断程序。