Bruker ProteoScape and CCS-centric Data Analysis with timsTOF Pro mass spectrometer

We developed Bruker ProteoScape (Parallel Database Search Engine in Real-Time), which performs database searching in parallel with data acquisition on a high-speed timsTOF Pro mass spectrometer. To perform a database search in real-time, Bruker ProteoScape adopts a fast IP2GPU search engine. With a recent breakthrough of 4D proteomics by the timsTOF Pro adding an extra dimension of separation, we developed CCS-centric algorithms to improve both protein identification and quantification.

Bruker는 timsTOF pro 데이타를 실시간으로 분석할 수 있는 Bruker ProteoScape라는 플렛폼을 개발하였습니다. 빠른 분석을 위해 IP2GPU서치 엔진을 사용하고 있습니다. 최근 timsTOF Pro가 precursor ion mobility정보를 제공하며 4D proteomics를 지원하므로, Bruker에서 단백질을 찾거나 정량할 때 사용할 수 있는CCS-centric 분석 알고리즘을 개발하였습니다.  이러한 소프트웨어를 통해 대량의 데이터를 빠르게 처리하고,  더 많은 정보들을 효과적으로 운영할 수 있습니다.  본 웨비나를 통해 Bruker 가 제공하는 timsTOF pro 와 Bruker ProteoScape/ CCS 기반의 플랫폼에 대해 경험해 보시기 바랍니다.

Korea：April 13th, 2021

Time: 10:00am-11:00am (KST)

Language: Korean

• Bioinformatics capabilities of the timsTOF Pro
• A scalable, ultrafast search engine with IP2GPU
• A complete infrastructure for proteomics data analysis
• Real-time search possibilities